Pajić je pod istragom Tužilaštva BiH i osumnjičen je da je u periodu od maja do kraja decembra 1992. godine, za vrijeme oružanog sukoba u Bosni i Hercegovini između Vojske Republike Srpske i Armije Republike BiH, u svojstvu vojnika VP 7344 Vlasenica, na području općine Vlasenica, postupao suprotno pravilima međunarodnog humanitarnog prava za vrijeme rata.
On se sumnjiči za sudjelovanje u višestrukim silovanjima i seksualnim zlostavljanjima jedne žene bošnjačke nacionalnosti, kao i još jedne maloljetne žrtve, te nečovječnom postupanju, nanošenju snažne fizičke i psihičke patnje i mučenju, zatočenih civila, muškaraca bošnjačke nacionalnosti u prostorijama SUP-a Vlasenica.
Slađan Pajić osumnjičen je da je počinio krivično djelo ratni zločin protiv civilnog stanovništva.
Nakon lišenja slobode, osumnjičeni Pajić će biti predat postupajućem tužiocu koji će ispitati osumnjičenog i nakon toga donijeti odluku o podnošenju prijedloga za određivanje mjere pritvora ili mjera zabrane u skladu sa zakonom, saopćeno je iz Tužilaštva BiH.